Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1BQ53T94 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms