Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSD17B12Q53GQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSD17B12Q53GQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms