Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A4Q53GD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC44A4Q53GD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC44A4Q53GD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms