Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIN52Q52LA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms