Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A12Q504Y0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A12Q504Y0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms