Protein–RNA interactions for Protein: Q49A92

C8orf34, Uncharacterized protein C8orf34, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf34Q49A92 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C8orf34Q49A92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C8orf34Q49A92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms