Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2CQ496J9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms