Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX4Q33E94 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX4Q33E94 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX4Q33E94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX4Q33E94 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX4Q33E94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX4Q33E94 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX4Q33E94 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RFX4Q33E94 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX4Q33E94 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX4Q33E94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX4Q33E94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX4Q33E94 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX4Q33E94 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms