Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTC1Q2NKJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTC1Q2NKJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms