Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEN1Q17RS7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEN1Q17RS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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