Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN21Q16825 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN21Q16825 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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