Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXD1Q16676 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FOXD1Q16676 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXD1Q16676 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXD1Q16676 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXD1Q16676 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXD1Q16676 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXD1Q16676 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FOXD1Q16676 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FOXD1Q16676 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FOXD1Q16676 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FOXD1Q16676 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FOXD1Q16676 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXD1Q16676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FOXD1Q16676 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXD1Q16676 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms