Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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NFIL3Q16649 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIL3Q16649 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIL3Q16649 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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