Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FXNQ16595 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXNQ16595 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXNQ16595 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXNQ16595 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXNQ16595 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXNQ16595 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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