Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYPL1Q16563 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYPL1Q16563 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYPL1Q16563 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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