Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNAPC1Q16533 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNAPC1Q16533 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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