Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY1Q16526 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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