Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SF3B3Q15393 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B3Q15393 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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