Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3CQ15386 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3CQ15386 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3CQ15386 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms