Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRRQ15256 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms