Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NCAPD2Q15021 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NCAPD2Q15021 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCAPD2Q15021 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
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