Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPHQ15003 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPHQ15003 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPHQ15003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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