Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
GAPVD1Q14C86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
GAPVD1Q14C86 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GAPVD1Q14C86 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
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