Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME4Q14997 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSME4Q14997 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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