Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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