Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EBI3Q14213 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EBI3Q14213 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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