Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53BQ14153 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM53BQ14153 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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