Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALCAMQ13740 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALCAMQ13740 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALCAMQ13740 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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