Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMK2BQ13554 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2BQ13554 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms