Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3AQ13472 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3AQ13472 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3AQ13472 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3AQ13472 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP3AQ13472 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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