Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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