Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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