Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms