Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTK7Q13308 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTK7Q13308 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK7Q13308 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms