Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
GRIN2BQ13224 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2BQ13224 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2BQ13224 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
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