Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA4Q13156 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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