Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPS1Q13098 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPS1Q13098 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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