Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRDNQ13061 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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