Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFX1Q12986 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFX1Q12986 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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