Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A2Q12908 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC10A2Q12908 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC10A2Q12908 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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