Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 WTM2YOR229W 1404 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 YJR124CYJR124C 1347 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 MNN10YDR245W 1182 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 ATP14YLR295C 375 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 CTR3YLR411W 726 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 SCP1YOR367W 603 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 PZF1YPR186C 1290 nt5.09□□□□□ -1.59
LDB17Q12342 YIL067CYIL067C 2037 nt5.09□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 PDR10YOR328W 4695 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 UGA1YGR019W 1416 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 CAB4YGR277C 918 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 RPB4YJL140W 666 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 DCI1YOR180C 816 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 CLA4YNL298W 2529 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 IMA1YGR287C 1770 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 PHO90YJL198W 2646 nt5.08□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 YGL185CYGL185C 1140 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 BGL2YGR282C 942 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 DBP8YHR169W 1296 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 CSR1YLR380W 1227 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ADD37YMR184W 597 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 SCW10YMR305C 1170 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 BUB3YOR026W 1026 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ETT1YOR051C 1239 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 MRI1YPR118W 1236 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 MCM4YPR019W 2802 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 JEM1YJL073W 1938 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 UBP9YER098W 2265 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 APM2YHL019C 1818 nt5.07□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 MGS1YNL218W 1764 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 PMT2YAL023C 2280 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 UBA2YDR390C 1911 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 GRX4YER174C 735 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 FUN19YAL034C 1242 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 BUD28YLR062C 378 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 YLR346CYLR346C 306 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 BRE2YLR015W 1518 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ELP2YGR200C 2367 nt5.06□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 FUI1YBL042C 1920 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ZUO1YGR285C 1302 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ATH1YPR026W 3636 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 RPL28YGL103W 450 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 MRL1YPR079W 1146 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 NOT3YIL038C 2511 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 SEC39YLR440C 2130 nt5.05□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 SUM1YDR310C 3189 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 DAL81YIR023W 2913 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ADE3YGR204W 2841 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 HXT4YHR092C 1731 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 NSG1YHR133C 876 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 GAT4YIR013C 366 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ECM1YAL059W 639 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 ARN1YHL040C 1884 nt5.04□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 VHS2YIL135C 1311 nt5.03□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 SAP155YFR040W 3009 nt5.03□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 UPS3YDR185C 540 nt5.03□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 YJR085CYJR085C 318 nt5.03□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 MBP1YDL056W 2502 nt5.03□□□□□ -1.6
LDB17Q12342 PAL1YDR348C 1500 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 MSH1YHR120W 2880 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 RSC6YCR052W 1452 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 MHF2YDL160C-A 243 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 AAD4YDL243C 990 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YNL228WYNL228W 777 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 HPC2YBR215W 1878 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PSE1YMR308C 3270 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SED4YCR067C 3198 nt5.02□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 STE12YHR084W 2067 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 FAU1YER183C 636 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 THI5YFL058W 1023 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 LDB18YLL049W 540 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YLR283WYLR283W 945 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PRE7YBL041W 726 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 THI12YNL332W 1023 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PPG1YNR032W 1107 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 MET31YPL038W 534 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 STE7YDL159W 1548 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PXA1YPL147W 2613 nt5.01□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 MTC1YJL123C 1437 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SIS2YKR072C 1689 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 TRS23YDR246W 660 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YGR122WYGR122W 1209 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PUS6YGR169C 1215 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SFT2YBL102W 648 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SSO1YPL232W 873 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 TPS3YMR261C 3165 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 KRS1YDR037W 1776 nt5□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 HXT14YNL318C 1623 nt4.99□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 GLE2YER107C 1098 nt4.98□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SFK1YKL051W 1062 nt4.98□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.98□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt4.98□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 PCL8YPL219W 1479 nt4.98□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 ATR1YML116W 1629 nt4.97□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 STE20YHL007C 2820 nt4.97□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 YHR140WYHR140W 720 nt4.97□□□□□ -1.61
LDB17Q12342 SPS18YNL204C 903 nt4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms