Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q0VFX4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q0VFX4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q0VFX4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q0VFX4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q0VFX4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q0VFX4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q0VFX4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q0VFX4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q0VFX4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q0VFX4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q0VFX4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q0VFX4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q0VFX4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q0VFX4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q0VFX4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q0VFX4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q0VFX4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q0VFX4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q0VFX4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q0VFX4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms