Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC15Q0P6D6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC15Q0P6D6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms