Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFFO1Q0D2I5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFFO1Q0D2I5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms