Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD47Q08722 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD47Q08722 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD47Q08722 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD47Q08722 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD47Q08722 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD47Q08722 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD47Q08722 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD47Q08722 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD47Q08722 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD47Q08722 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CD47Q08722 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CD47Q08722 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CD47Q08722 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD47Q08722 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms