Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD300CQ08708 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD300CQ08708 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms