Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXM1Q08050 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms