Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF9Q07011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms