Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 RBBP4-214ENST00000492348 1547 ntTSL 27.98□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-20■■■■■ 29.2
FMR1Q06787 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 29.2
FMR1Q06787 LTBP4-214ENST00000595665 576 ntTSL 420.1■□□□□ 0.812e-12■■■■■ 29.2
FMR1Q06787 LTBP4-237ENST00000622107 590 ntTSL 418.73■□□□□ 0.592e-12■■■■■ 29.2
FMR1Q06787 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 222.08■■□□□ 1.137e-8■■■■■ 29.1
FMR1Q06787 ARHGEF2-218ENST00000608543 820 ntTSL 319■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 29.1
FMR1Q06787 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -18e-7■■■■■ 29.1
FMR1Q06787 PRPF8-208ENST00000573716 542 ntTSL 216.37■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 425.26■■□□□ 1.639e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 222.38■■□□□ 1.179e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.849e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-204ENST00000433749 603 ntTSL 47.67□□□□□ -1.189e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-207ENST00000469944 686 ntTSL 36.84□□□□□ -1.319e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.669e-8■■■■■ 29
FMR1Q06787 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.66□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 29
FMR1Q06787 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 DNMT1-227ENST00000592342 636 ntTSL 325.13■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 523.91■■□□□ 1.423e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 DNMT1-214ENST00000588118 973 ntTSL 515.49■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 513.74□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 DNMT1-210ENST00000586800 583 ntTSL 37.37□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 RBBP4-208ENST00000463378 882 ntTSL 59.28□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 RBBP4-207ENST00000460669 783 ntTSL 56□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 RBBP4-212ENST00000482190 616 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 RBBP4-210ENST00000475321 619 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 28.9
FMR1Q06787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.684e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.414e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 ZNRF2P2-201ENST00000426767 663 ntTSL 329.53■■■□□ 2.324e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.093e-15■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.053e-15■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-211ENST00000443810 593 ntTSL 325.56■■□□□ 1.684e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)25.03■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 223.85■■□□□ 1.411e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-203ENST00000412879 561 ntTSL 423.36■■□□□ 1.334e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 FURIN-202ENST00000558794 844 ntTSL 523.23■■□□□ 1.314e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-15■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.21e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UBN1-207ENST00000589191 705 ntTSL 321.61■■□□□ 1.054e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-214ENST00000458600 801 ntTSL 321.31■■□□□ 14e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 COX10-203ENST00000580561 1384 ntTSL 221.31■■□□□ 14e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 COX10-204ENST00000581931 1509 ntTSL 221.02■□□□□ 0.964e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IPO4-205ENST00000558233 1015 ntTSL 519.4■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 219.26■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 219.05■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RB1-205ENST00000525036 1490 ntTSL 318.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RB1-202ENST00000467505 480 ntTSL 1 (best)18.51■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 217.53■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TAF4-205ENST00000488539 645 ntTSL 516.72■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 LINC00665-201ENST00000412740 715 ntTSL 316.56■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-228ENST00000533219 752 ntTSL 316.34■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-206ENST00000427084 749 ntTSL 516.3■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 BCR-203ENST00000419722 788 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-15■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-208ENST00000434185 565 ntTSL 415.8■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-204ENST00000420970 1060 ntTSL 513.49□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-205ENST00000426396 641 ntTSL 513.49□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UBTF-207ENST00000529042 535 ntTSL 312.59□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-213ENST00000449676 533 ntTSL 412.34□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 POLR1A-205ENST00000462078 469 ntTSL 512.19□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 LINC00665-204ENST00000449434 651 ntTSL 212.04□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 511.68□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-218ENST00000528931 2868 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 IMMP1L-209ENST00000532287 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SLC25A17-201ENST00000263255 2058 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 28.8
FMR1Q06787 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 62.9 ms