Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms